برخلاف تصور رایج که آن را مصداقی از «توزیع عادلانه آب» میان مناطق می‌‌‌پندارد، طرح‌‌‌های انتقال آب بین‌حوضه‌‌‌ای پیامدهای سنگینی، هم بر حوضه مبدأ و هم بر حوضه مقصد تحمیل می‌کند. در حوضه‌‌‌های مبدأ، شواهد متعدد از کاهش شدید جریان‌‌‌های سطحی، خشک‌‌‌شدن تالاب‌‌‌ها و رودخانه‌‌‌های دائمی، نابودی تدریجی کشاورزی،